国防部は申前司令官事件を軍首脳部が把握した時点をめぐり一日で言葉を変え、事件を縮小・隠蔽しようとしたのではという疑惑を自ら招いた。２日には「事件発生後に公式的に報告を受けたことはなく、最近、人事系統を通じて事件を知った」と話していたが、３日には「事件を知った首都防衛司令部がすぐに（６月１９日）陸軍本部に報告し、当時の権五晟（クォン・オソン）陸軍総長が申前司令官に指揮所（公館）にすぐに復帰するよう命じたことが確認された」と述べた。


ユン一等兵死亡事件も管轄権が移転されると死亡の原因が変わった。初期捜査が十分でなかったことを如実に表した。最初に事件を担当した第２８師団軍検察団はユン一等兵が「気道閉鎖による脳損傷」、すなわち食べ物で気道がふさがり呼吸困難で死亡したという結論を出し、加害者に傷害致死罪を適用した。しかし事件を新たに引き受けた第３軍司令部軍検察団は２日、ユン一等兵の死因を暴行によるショックのためだと修正し、加害者４人を殺人および傷害致死容疑などで起訴すると明らかにした。軍の言葉の言い換えと不徹底な事件処理が疑惑ばかり深めることになった。