専門家がオミクロン株の感染力が高いとみているのはスパイク（突起）タンパク質で確認された突然変異が多いためだ。オミクロン株のスパイクタンパク質からはデルタ株の２倍を越える３２の突然変異が確認された。通常コロナウイルスは突き出たスパイクを人体の細胞に結合して感染を引き起こすが、この部位に突然変異が多い場合、抗体を避けて体内に入り込む可能性が高くなり伝染力が強くなる場合がある。特に受容体結合ドメイン（ＲＢＤ、ウイルスが宿主の細胞受容体と結合する領域）でデルタ株の突然変異が２～３だったのに比べて、オミクロン株は１５あることが分かった。ただし、一部では突然変異があまりにも頻繁に繰り返した場合、ウイルスの適応力が低下するため、デルタ株よりも感染力は弱いかもしれないという主張もある。


オミクロン株が重篤率や致命率を高めるかどうかに対しても解釈が交錯している。オミクロン株の変異株を初めて報告した南アフリカ共和国の医師アンジェリーク・クッツェー氏は２７日（現地時間）、英国日刊紙テレグラフとのインタビューで「症状が特異だが軽微だ（ｍｉｌｄ）」と明らかにした。クッツェー氏は「患者の中には強い倦怠感を訴える若者が多かった。患者２０人のうち大部分は健康な男性で、半分は予防接種を打っていなかった」とし「味覚や嗅覚の喪失を経験した者はいなかった」と述べた。イングランド公衆衛生庁（ＰＨＥ）上席医療顧問のスーザン・ホプキンス氏は「新たな変異株が深刻な症状を誘発するという信号はまだない」と説明した。