１９７０年代初めに４万６０００人だった生徒数は２０００年代以降、急減している。２００９年ごろ１万人を割り、最近は５０００人台に減少した。これを受け、学校の統廃合が加速し、２００９年に７６校（１１校は休校）だった日本全国の朝鮮学校は今年は６４校（３校休校）に減った。


日本政府が朝鮮学校を無償教育から排除し、減少傾向はさらに強まっている。日本政府は２０１０年に高校無償教育を実施し、当初は朝鮮学校も他の外国人学校と同じく適用の対象に含めた。しかし同年１１月２３日に北朝鮮が延坪島（ヨンピョンド）砲撃事件を起こすと、当時の民主党政権が朝鮮学校を無償教育の対象から除外した。その後、朝鮮学校側は民族差別だとして東京、名古屋、大阪、広島など各地域の裁判所に提訴した。このうち東京、大阪地裁は原告敗訴を確定した。